Bulletin PLUME sept-oct

[Jean-Luc Archimbaud <Jean-Luc.Archimbaud AT urec.cnrs.fr>]

Bonjour,

Ci-dessous un résumé des informations et des nouvelles fiches publiées 
sur la plate-forme PLUME (http://www.projet-plume.org/) en sept et oct 2010.
Pour être tenu au courant en temps réel des nouvelles publications, 
abonnez vous au fil RSS : http://www.projet-plume.org/aggregator/rss/3
Désolé pour les réceptions multiples,
Jean-Luc pour l'équipe PLUME
http://www.projet-plume.org/equipe-plume


Informations
* PLUME fête ses 3 ans avec 800 fiches publiées : le communiqué de 
presse : http://www.projet-plume.org/files/Plume-communique-R-nov-2010.pdf
* Publication du document : Synthèse de l'étude "Pratiques de 
développement - ForgeESR" : 
http://www.projet-plume.org/ressource/synthese-de-letude-pratiques-de-developpement-forgeesr
* Conférence FOSSa (Free Open Source Academia Conference) à Grenoble du 
8 au 10 nov : 
http://www.projet-plume.org/breve/conference-fossa-grenoble-8-10-nov-2010

Nombre de mises à jour (avec relecture de l'auteur) de fiches logiciels : 57

Fiches logiciels validés (en production sur 3 sites au moins)
http://www.projet-plume.org/fiches/dates_toutes

* samtools : manipuler des alignements au format SAM/BAM (biologie) - 
Nicolas Allias (LGC Plateforme bioinformatique Toulouse)
* Mychem : manipulation de données chimiques dans MySQL - Jérôme 
Pansanel (IPHC)
* StarUML : modélisation UML (similaire à 'Rational Rose' ou 'Borland 
Together') - Laurent Tiercin (LAAS puis EDF)
* GanttProject : gestion de projets - Dirk Hoffmann (Centre de Physique 
des Particules de Marseille (CPPM-IN2P3))
* Gabedit : interface graphique pour différentes applications de chimie 
computationnelle - Lionel Nauton (SEESIB)
* OptimOffice : chaîne éditoriale pour créer et publier des documents 
bureautiques - Mathias Gérard (Unité d'innovation "Ingénierie des 
contenus et des savoirs")
* ESO-MIDAS : système de traitement d'images (astronomie) - Jose Donas 
(Laboratoire d'Astrophysique de Marseille (LAM))
* Blender : modélisation, animation et rendu 3D - Damien Marchal 
(IRCICA-LIFL/Lille)
* NX (Freenx) : connexions graphiques distantes à un bureau Linux / Unix 
- Jacques Foury (CEMAGREF, centre de Bordeaux)
* Firebug : extension Firefox, débogueur JavaScript, XHTML, CSS - 
Emmanuel Courcelle (LIPM)
* eXist-db : gestionnaire de base de données XML native - Clément Plancq 
(LLF )
* SOGo : plateforme de travail collaboratif (partage agenda, carnet 
d'adresses, tâches, webmail) - Thomas Olivier (Université de Lille 1 - CRI)
* GNU Screen : multiplexeur de terminaux en mode texte - Michel Le Cocq 
(LAGA/LIPN)
* PLONE : création de site Web et gestion de contenus (CMS) - Vladimir 
Daric (CNRS Délégation IDF-Sud / Service des Systèmes d'Information )
* J2ME : développement d’application mobile sur machine virtuelle Java - 
Laurent Tiercin (LAAS puis EDF)
* OpenAlea : modélisation des plantes à différentes échelles - Samuel 
Dufour-Kowalski (AMAP )
* FlashBlock : extension pour Firefox et compatibles - Olivier 
Brand-Foissac (LPT Orsay)
* PyMCA : analyse des spectres de fluorescence X, visualisation 
hyperspectrale - Jérôme Kieffer (ESRF)
* SWIG : interfacer des programmes C, C++ avec des programmes python, 
perl... - Loic Gouarin (Laboratoire de Mathématiques Orsay)
* Piwik : statistiques web (alternative à Google Analytics) - Jérémy 
Lavaux (INIST)

Fiches logiciels à valider (en production sur un site uniquement)
http://www.projet-plume.org/logiciels_a_valider

* OGR2GUI : conversion de formats de données spatiales (géographie)
* Violet UML Editor : éditeur UML simple à utiliser


Fiches ressources (en lien avec des logiciels)
http://www.projet-plume.org/ressources/dates

* SPDX : format pour communiquer licences et copyrights associés aux 
briques logicielles
* Format SAM : Sequence Alignment/Map (biologie)
* pdfreaders.org : recensement des lecteurs PDF libres
* Communiqué de presse PLUME - Novembre 2010
* Journée JoSy-PLUME 'Les outils libres de base utiles à tout ASR 
(Administrateur Système Réseau) ' 22 nov 2010 à Paris
* OpenID dans PLUME
* Wayback Machine : archive de sites Web
* Synthèse de l'étude "Pratiques de développement - ForgeESR"
* Les services web de type REST
* Référentiel Général d'Accessibilité pour les Administrations (RGAA)
* Format SVG (Scalable Vector Graphics)
* Séminaire JoSy "ASR pour la science" - oct 2010
* Format FITS : Flexible Image Transport System (astronomie)
* Bilan à trois ans de PLUME : les services rendus aux laboratoires de 
recherche et aux universités - septembre 2010
* Rencontre DevelopR6 sur la diffusion et la valorisation des logiciels 
- Nancy - sept 2010
* Webinaire : description et outils
* IPRA (Intellectual Property Rights Analysis) : pour renforcer la 
confiance dans les logiciels issus de la recherche

Fiches Dév ESR (développement de la communauté Ens Sup Recherche)
http://www.projet-plume.org/relier/dates

* Ork : API orientée objet en C++ au dessus de OpenGL pour OpenGL 
Rendering Kernel - Eric Bruneton (LJK EVASION)
* Indico : organisation de réunions, séminaires et conférences - 
Christian Helft (LAL)
* MIC2M : modélisation et identification du comportement mécanique non 
linéaire des matériaux - Fabrice Richard (Université de Franche-Comté - 
FEMTOST Méc'Appli)
* Gabedit : interface graphique pour différentes applications de chimie 
computationnelle - Abdul-Rahman Allouche (LASIM)
* Muses3D : simulation de la dynamique de brouillards de gouttes 
polydispersées - Lucie Freret (Laboratoire d'Imagerie Paramétrique)

Fiches Dév ESR en anglais
http://www.projet-plume.org/en/relier/list_by_date

* Mixmod : a software for supervised and unsupervised classification - 
Florent Langrognet (Laboratoire de Mathématiques de Besancon)
* EDNA : framework for plugin-based applications for online data 
analysis - Jérôme Kieffer (ESRF)
* Indico : event organization - Teresa Gomez-Diaz (LIGM)
* Gabedit : a graphical user interface for computational chemistry 
softwares - Abdul-Rahman Allouche (LASIM)
* HECTAR : subcellular localisation, heterokonts, support vector 
machine, metaclassifier, motif, annotation - Bernhard Gschloessl 
(Génétique et Développement)