Re: [EDUC] Recherche d'un logiciel libre multiplateforme réalisant des schémas moléculaire 2D de chimie : synthèse

[Ghislain Fabre <ghislain.fabre AT open-elearning.com>]

Bonjour à tous,

Tout d'abord merci à tous pour les retours que vous avez fait sur le sujet.

Voici une petite synthèse en espérant qu'elle puisse servir à gagner du 
temps si d'autres par la suite planchent sur la mutualisation 
d'illustrations 2D de schémas moléculaires (ex. mutualisation de tests 
de positionnement, manuel scolaire libre collaboratif, etc.).

La solution qui semblait la plus intéressante est 
http://py-chemist.com/mol_2_chemfig car :
- Elle ne nécessite pas d'installation (un navigateur web suffit - gain 
de temps, surtout en contexte de production multi-auteur)
- Elle est donc multi-plateforme (important aussi pour l'aspect de 
mutualisation)
- Elle permet de rechercher dans des bases de données par le nom de 
molécules
- Elle affiche aussi en latex
- Pour les allergiques au latex, il est possible de dessiner la molécule 
avec des outils WYSIWYG
- Elle peut importer des fichiers .mol
- Les rendus correspondent aux besoins pédagogiques exprimés (cf. 
anciens messages)

Mais :
- Elle ne permet pas d'exporter en png ou svg (remarque : possibilité de 
conversion avec d'autres solutions du pdf vers ces formats)
- Et surtout je viens de m’apercevoir qu'elle n'est pas libre... (cf. 
http://py-chemist.com/mol_2_chemfig/about ) ce qui serait critique pour 
un projet de mutualisation dans le temps.

En revanche :
- Elle semble être un assemblage de solutions libres, ainsi si d'autres 
se penchent plus tard sur le sujet, ils pourront gagner du temps en s'en 
inspirant, ou en essayant de contacter l'auteur pour qu'éventuellement 
il libère la solution, à voir si un financement collaboratif pourrait 
l'encourager par exemple http://py-chemist.com/mol_2_chemfig/about (à 
noter que pas mal d'établissements lâchent 2000 à 3000€ par licence pour 
acheter des logiciels propriétaires de dessins moléculaires, une 
mutualisation sur du libre serait rapidement amortie)

Aussi, le lien 
https://framacalc.org/comparaison-solutions-libres-de-visualisation-moleculaire 
propose un début de comparaison de différentes solutions, s'il n'est 
plus valide au moment ou vous souhaitez y accéder vous pourrez m'envoyer 
un courriel pour voir si je dispose toujours de la sauvegarde au format 
.ods.

Voilà...

à+

Ghis

Le 01/09/2016 à 16:56, Ghislain Fabre a écrit :
> Bonjour à tous,
>
> Dans le cadre d'un accompagnement d'une enseignante de chimie 
> organique, en vue de mutualiser des tests d'évaluations formatives et 
> remédiations entre diverses universités et grandes écoles, nous 
> cherchons un logiciel ayant les caractéristiques suivantes :
> - qui fait des rendus 2D de molécules (ex. 
> https://fr.wikipedia.org/wiki/Chimie_organique#/media/File:Imatinib_mesylate.svg 
> ) ;
> - sous licence libre ;
> - qui exporte en png ;
> - qui s'installe facilement, notamment sur mac (utilisée par 
> l'enseignante) ;
> - qui soit multiplateforme ;
> - qui réalise intuitivement des représentations 2D correctes (ex. 
> https://framapic.org/rhYIRBZfqpl7/jc43ZCCbZ2uF.png ici , en haut à 
> gauche, il y a une double liaison sur le H au lieu du C ; ici 
> https://framapic.org/B0Jiiw8DgJWm/zYoZSxj64B8x.png l'enseignante 
> souhaiterait que qu'il y ait écrit HOOC au lieu de COOH en haut à 
> gauche).
>
> Si on arrive à identifier un tel logiciel, celui-ci pourrait ensuite 
> être préconisé aux participants à cette mutualisation en chimie 
> organique, en vue d'homogénéiser les rendus des questions.
>
> On a regardé sur https://framasoft.org/rubrique276.html , 
> https://www.reseau-canope.fr/sialle/logiciels.php?niv=lycee&disc=ENSCHBIOENPRO 
> et 
> https://www.ufrgs.br/soft-livre-edu/wiki/Tableau_Dynamique_Logiciels_%C3%89ducatifs_Libres 
> mais sans avoir encore tout testé et trouvé cette perle rare.
>
> BKchem posait problème pour être installé sur la version de MacOS de 
> l'enseignante, JChemPaint semble intéressant.
>
> Pour les enseignants de chimie, avez-vous des retours d'expériences 
> sur cet usage ? Quel logiciel libre conseilleriez-vous ? Quel logiciel 
> utilisez-vous ?
>
> Merci :)
>
> Ghislain


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