PLUME avril 2010

[Jean-Luc Archimbaud <Jean-Luc.Archimbaud AT urec.cnrs.fr>]

Bonjour,
Le site PLUME (Promouvoir les Logiciels Utiles Maîtrisés et Economiques 
dans l'Enseignement Supérieur et la Recherche) 
http://www.projet-plume.org/ offre un ensemble de descriptifs de 
logiciels, en très grande majorité libres, utilisés ou développés par 
cette communauté. Ci dessous, un résumé des nouvelles fiches publiées en 
avril et quelques nouvelles informations.
Désolé pour les réceptions multiples,
Cordialement,
Jean-Luc pour l'équipe PLUME
http://www.projet-plume.org/equipe-plume

PS : je diffuse le message suivant dans cette liste suivant le conseil 
de Tangui Morlier qui m'a indiqué cette liste comme étant la mieux adaptée.

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Informations

    * Description de l'équipe PLUME :
http://www.projet-plume.org/equipe-plume
et de l'organisation du projet :
http://www.projet-plume.org/le-projet-organisation

    * Nouveau document de référence pour les auteurs ou responsables 
d'un logiciel dans un laboratoire de recherche : Diffuser un logiciel de 
laboratoire : recommandations juridiques et administratives :
http://www.projet-plume.org/ressource/diffuser-logiciel-recomm-juridiques-admin

    * Remise en forme de la page thématique biologie :
http://www.projet-plume.org/biologie

Fiches logiciels validés (en production sur 3 sites au moins)
http://www.projet-plume.org/fiches/dates_toutes

    * Kile : éditeur de texte Latex - Rémi Vernay (LE2I)
    * GMSH : modeleur/mailleur/visualiseur - Loïc Gouarin (LAGA)
    * FFTW : bibliothèque effectuant des transformées de Fourier 
complexes ou réelles, rapides et portables - Nathanaël Schaeffer (LGIT)
    * Fedora Commons : système de gestion et entrepôt de contenus 
numériques - Pierre-Yves Jallud (TGE-ADONIS)
    * GRR : réservation de ressources (salles, matériels), agenda... - 
Valérie Cantonny (Institut de Biologie des Plantes, Plateforme 
Metabolisme Metabolome)
    * ANT : outil d'automatisation des tâches pour la production d'un 
logiciel - Clive Canape (IRD DSI - IS)
    * Tomcat : conteneur de Servlet Java et Page JavaServer (JSP) - 
Samuel Godey (UREC Paris)
    * python : langage multi-paradigme et multi-usage - Loïc Gouarin (LAGA)
    * CAS : service d'authentification centralisé pour applications Web 
- Samuel Godey (UREC Paris)
    * RDVZ : mise en place de rendez-vous entre plusieurs personnes par 
sondage - Véronique Baudin (LAAS)

Fiches logiciels à valider (en production sur 1 site)
http://www.projet-plume.org/logiciels_a_valider

    * phpCollab : gestion collaborative de projets via le web - Olivier 
Brand-Foissac (Laboratoire de Physique Théorique)

Fiches logiciels en test
http://www.projet-plume.org/logiciels_en_test

    * Eyes Of Network : solution de supervision système et réseau - 
Stéphane Rossi (DSI CNRS)

Fiches ressources (en lien avec des logiciels)
http://www.projet-plume.org/ressources/dates

    * Link checker : vérification d'hyperliens
    * Alternatives OpenSource : référentiel d'équivalents Open Source à 
des logiciels propriétaires
    * Protocole OAI-PMH
    * Anubis : analyse d'exécutables Windows (détection de code 
malveillant...) en ligne
    * VirusTotal : analyse antivirus de logiciel en ligne
    * Diffuser un logiciel de laboratoire : recommandations juridiques 
et administratives
    * ARAMIS : réseau métier Admin Syst Réseau et Développeurs 
Rhône-Auvergne
    * Journée PLUME-Cléo 'Communication scientifique en ligne : outils 
libres (CMS, wikis, blogs, ...), pratiques et analyses' 16 juin 2010

Fiches Dév ESR (développement de la communauté Ens Sup Recherche)
http://www.projet-plume.org/relier/dates

    * FactoMineR : package du logiciel R dédié à l'analyse de données - 
Julie Josse (Laboratoire de mathématiques appliquées Rennes Agrocampus 
Ouest)
    * REPET : annotation des éléments transposables (génomique) - 
Olivier Inizan (URGI)
    * ElVis : fluides visco-éLastiques dans des films minces - 
Sébastien Martin (Laboratoire de Mathématiques d'Orsay)
    * GraMoFoNe : un plugin pour Cytoscape - Florian Sikora (LIGM)
    * Mobyle : framework pour intégrer les logiciels bioinformatiques - 
Anthony Bretaudeau (Plateforme de Bio-informatique GenOuest)
    * PARI/GP : logiciel de calcul formel spécialisé en arithmétique - 
Karim Belabas (Institut de Mathematiques de Bordeaux)
    * STUdS : outil de sondage pour déterminer une date ou un lieu de 
réunion, un thème de travail, ..... - Guilhem Borghesi (Direction 
Informatique Univ. de Strasbourg)
    * NITSOL_POD : accélération de la méthode de Newton par POD - 
Damien Tromeur-Dervout (ICJ)
    * PIPCL : bibliothèque de couplage de code - Damien Tromeur-Dervout 
(ICJ)
    * AITKENBRATU_2.5d : résolution du problème séparable (Bratu) par 
décomposition de Schwarz accélérée par Aitken - Damien Tromeur-Dervout (ICJ)
    * BFL_DDM_PF : bases de Fourier locales et décomposition de domaine 
pour simuler un front de polymérisation - Damien Tromeur-Dervout (ICJ)
    * SHTns : transformée en harmoniques sphériques, performante et 
flexible - Nathanaël Schaeffer (LGIT)
    * Bio++ : ensemble de bibliothèques C++ dédiées à la 
bioinformatique - Sylvain Gaillard (INRA Angers-Nantes, Unité de 
Génétique et Horticulture)
    * SWUMM : résolution des équations de Saint-Venant à l'aide d'une 
méthode de volumes finis multiniveaux - Arthur Bousquet (Institute for 
Scientific Computing and Applied Mathematics - Indiana University)
    * Dinah : plateforme philologique pour la construction de documents 
multistructurés - Pierre-Edouard Portier (LIRIS INSA Lyon)

Fiches Dév ESR en anglais
http://www.projet-plume.org/en/relier/list_by_date

    * GAGG : algorithm (R code) allowing gene clustering - Florian 
Salipante (IGF - Contrôle de l'apoptose et de la prolifération dans les 
systèmes neuronaux et endocriniens)
    * GraMoFoNe : a Plugin for Cytoscape - Florian Sikora (LIGM)
    * Topological watershed : n-dimensional image segmentation - Teresa 
Gomez-Diaz (LIGM)
    * Paraloop : distributing parallel jobs - Emmanuel Courcelle (LIPM)